Wily Máquina 5, también referida como Wily Machine Number 5 (ワイリーマシン5号,Wairī Mashin Gōgō?), es el quinto modelo de la línea de vehículos personalmente piloteados por el Dr. Wily, conocidos como Wily Máquina.
Debido a su enorme poderío, el Dr. Wily le guarda una gran confianza. Su único punto débil es la torreta que dispara bombas elásticas, fuera de ello, no tiene ningún otro defecto. Aunque en su diseño original el capó de la cabina era convertible, debido a un error de cableado del Dr. Wily, este se desprende como si se tratará de un dispositivo de escape.
Estrategia: Al ingresar a la habitación de batalla te toparás de inmediato con la gigantesca Wily Máquina 5, apenas su Medidor de Vida se complete, Wily Máquina 5 activará el cañón succionador de la boca del cráneo en un intento de arrastrar a tu personaje y ocasionar daño de contacto (dicho succionador estará activo toda la batalla), en tanto, Wily Máquina 5 avanzará hasta cubrir 2/3 de la pantalla y luego regresará a su posición original, volverá avanzar y cuando regrese disparará desde su cañón bucal 1 enorme bola azul que rebota en pantalla, avanzará por tercera vez mientras bota otra enorme bola azul, al regresar empezará a disparar 3 misiles desde su cañón inferior, alternado así: 2 bolas azules → 3 misiles, mientras avanza y retrocede. Debes disparar al cañón en la boca del cráneo para ocasionarle daño, si usas el Super Arrow solo necesitarás de 7 flechas para destruir el enorme vehículo, tras ser vencida, la cúpula rosada del capó saldrá volando dejando ver al Dr. Wily en la cabina del vehículo, el vehículo estallará y solo quedará la Wily Cápsula 2 en pantalla.
Dispara balas normales desde el agujero de abajo, balas defensivas en ángulo depresivo en respuesta a un ataque, una torreta equipada con una función de autodefensa.
Torreta andante para pelear contra Mega Man. Emite un láser en múltiples direcciones y se mueve para atrás hacia adelante con sus enormes patas en forma de avestruz. Su punto débil es la cabeza, ¡así que repite el disparo de salto mientras evitas el láser!